Jumlah Perguruan Tinggi : 10

Universitas Borneo Tarakan : https://poltekbiskal.ac.id/
Univertas Kaltara : http://unikaltar.ac.id/
STIE Bulungan Tarakan : https://stiebulungantarakan.ac.id/
STMIK PPKIA Tarakanita Rahmawati : https://ppkia.ac.id/
Sekolah Tinggi Ilmu Tarbiyah Ibnu Khaldun : https://stit-ik-nunukan.ac.id/
Politeknik Negeri Nunukan : https://pnn.ac.id/
Politeknik Bisnis Kaltara : https://poltekbiskal.ac.id/
Akademi Keperawatan Kaltara Tarakan : https://poltekkaltara.ac.id/
Politeknik Malinau : https://politeknikmalinau.ac.id/
Sekolah Tinggi Ilmu Tarbiyah Al-Anshar Tanjung Selor : www.stitalanshar.ac.id